腦功能基因組學研究所實驗動物中心成立于2004年初，同年12月獲得上海市實驗動物管理委員會頒發的《實驗動物使用許可證》（許可證號：SYXK(滬) 2004－0001），2009年、2014年順利通過五年換證復評審（許可證號：SYXK(滬) 2009－0065；許可證號：SYXK(滬) 2014－0006），2012年獲得實驗動物猴的擴項。2014年動物實驗設施面積達到2000m2，其中嚙齒類實驗使用面積為374.3 m2，靈長類動物中心建筑面積為1650m2。嚙齒類動物中心為屏障環境，屏障環境內采用IVC獨立送風籠具，主要飼養SPF級大鼠、小鼠，容納籠位約1800個。靈長類動物中心為開放系統，可飼養獼猴、狐猴和狨猴。

 

　　實驗動物中心現有工作人員11名，其中高級職稱1名，中級職稱5名，初級職稱4名，其它1名。嚙齒類動物中心使用的動物有SD、Long-Evans、Wistar大鼠、ICR、C57BL/6、CBA、KM、BALB/c小鼠、BALB/c-nu、NOD SCID及超過20個轉基因或基因敲除的小鼠品系。

 

　　實驗動物中心包括獸醫室、手術室、顯微注射室、細胞培養室以及動物行為學實驗室，配置了顯微鏡、解剖鏡、電子天平、大小鼠定位儀、培養箱、行為實驗設備等動物實驗的儀器設備，可供實驗人員進行動物行為實驗、顯微注射等實驗。